【Mendeley方案】文献管理软件协作

方法、技巧、工作流 领域最佳实践分享
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MN未来一年会对学术用途逐步做优化，团队也会提供官方的，更简化的操作教程。

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太棒了，我相信在对于高校在读本科生和在读的研究生，以及科研工作的人群来说，目前存在的笔记软件和文献管理软件之间不能很好的互通是一件难以解决的事情。当然我们并没有希望一个软件能解决所有问题，但是这样优秀的软件之间的相互支持无疑是极大地补充这种空缺。

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可以试试 zotfile插件。 把所有论文的pdf文件从zotero的数据库从提取出来，对于zotero来说，你的pdf只是个相对链接，它不要求你的pdf放在它的数据库中。 可参考知乎的文章 ：Zotero 跨平台同步附件的实现 Zotero 跨平台同步附件的实现 - 知乎

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我感觉关于学术论文的优化问题，真的可以参考
Mendeley（大包大揽，所有资料和pdf都在我家才行） 或 Zotero（论文元数据在这里，pdf按相对链接指定个地方就行）的方案；
但MN不只是用于学术，可能会有很多App都由自己的资源库，如何在Mac上让多个App的资源库中的PDF通过MN打开标注，完成后再回到对应App进行文档管理，个人觉得更适合各种不同需求的方向。

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关于自动化和插件扩展的开放接口内测征集参与者：
js定位为一种插件技术，而捷径和apple script定位为自动化技术。

3.6.5会开始支持apple script，已经在开发过程中，比较顺利（3.6.4如果没有意外会被跳版）。目前计划征集几位懂apple script的社区成员参与内测（可能未来一两周）。
另外已经比较确定MN会支持js作为内置扩展方式，类似字典扩展，制卡规则扩展都会采用js。开发者从ios的文档了解到apple已经把js bindings做的非常成熟，从而会有Jsbox这样的产品，js基本上就是apple官方指定的脚本引擎，无论从性能，稳定性，还是延展性角度，基本上可以做到通过js直接call内部methods。
js在iOS端可以和捷径结合（类似jsbox)，在mac端和apple script 结合。通过目前构想的技术结构，可以很容易的把apple script实现的功能开放给js。
整个技术演进应该会跨越3.6， 3.7两个版本，分步骤来做。可能在设计实现新同步框架时借助这套扩展结构。

开放接口预计考虑对接的需求场景：

定制化搜索——统计一个词出现的频率，现有的搜索会有全部结果，但没有统计，理想的情况是给出一串关键词，统计每个词的返回结果数

笔记本数据【输出】——自动定期备份并存储至第三方云

制卡自动化——MN是自由字段，不像anki那样，所以卡片得手动选择问题部分，实际上，这个通过脚本，是可以实现自动化的，用户自己定义一些规则，然后自动化生成需要的卡片，是否填空等

笔记录入，过滤导出——文字加工【输入】——Vocabulary.com 抓取最新实时（纽约时报等各大杂志）例句注入笔记粒度卡片。——。笔记输入的入口可以提供。另外，还可以提供一些过滤笔记，执行操作的接口，比如选择过滤一些手写，自动生成笔记，选择过滤一些笔记，自动生成卡片，等等。

各位可以对上述需求场景进行补充

Regards，
MarginNote Team

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首先超级期待MN更新，给辛苦的客服笔芯:heart:

然后提一个小小的建议，因为现在看文献基本是用endnote和mendeley，但是有些文章需要精读，然后在MN里汇集成学习本作脑图，一步步精读文献，感觉很棒的设计，但是有一点问题就是很多篇文献做完笔记之后可能就会继续读其他的文献了，过一段时间想起某篇文章的一般来说只会在mendeley和endnote里用内置阅读器查看，然后这个时候要保证在endnote和mendeley里阅读同步的话，必须要把笔记在每个pdf中先生成pdf，然后将生成的pdf传到电脑上（还有名称问题），最后在电脑上覆盖原文件。其他步骤都还能接受，不过是复制粘贴，可是笔记问题真的是很苦恼，为了让生成的pdf有笔记，必须要重新每一篇每一篇重新生成，非常慢效率很低，因此每次都很苦恼。

想求助一下客服可不可以更新一个，设置icloud端备份的pdf能否自动嵌入笔记这一选项。

感谢MN,感谢辛苦的客服。

再次笔芯:heart:

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你好，因为目前PDF与MarginNote笔记是不同属一个格式的文档数据，所以除非进行笔记备份两者才能一起导出，iCloud同步也因此是分开存储、同步的。
Regards,
Relight

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感谢MN客服及时回复！笔芯～

笔记和PDF分开存储了解啦～那请问有什么方法可以快速将PDF和笔记合成一个PDF呢？除了利用MN阅读器将PDF和笔记一起导出～

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目前只有一起导出，像上面说的后面可能会有人开发这方面插件扩展。

Regards

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可以导出打印版PDF的，见：Q1 如何导出文档？
Regards,
Relight

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这个看着很好不过感觉实用性可能没有想象中那么强吧。我有一个欧路词典的 vocabulary.com，它的例句是这个单词的所有义项混杂在一起的，而且没有中文意思，我看着很头疼。毕竟我想，大多数情况下英语学习者需要的是刚刚某个句子看不懂，所以查询其中单词的对应意思，需要的是分门别类的例句。
不过vocabulary的那个通俗的解释倒是挺好的，有时候正经的词典英英解释看不懂，看这个的一下就看懂了。

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重在可以自己注入来自其他来源的笔记，各种API查到的资料都可以通过这种方式注入笔记。这个只是举个例子，包括通过扩展支持MDX查询结果注入也是可以的

Regards

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好的，这类插件扩展可以在IOS上实现吗

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可以，IOS是，JS＋捷径，核心功能基本一致

Regards

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好的，是需要我们自己去在捷径里设计吗？

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是的，要么自己设计，要么用别人分享的

Regards

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我也是一般用marginnote来精读文献，我用的是zotero，文献pdf附件都放到了icloud中的marginnote3的文件夹中，但是很多情况下都会出现明明做了很多标记，再重新打开发现啥都没了，好像是复制了一个新的附件，这个是我目前使用marginnote非常不踏实的一点

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首先，更推荐使用MN自身的目录，而非icloud目录。

其次，MN的笔记是通过MD5绑定PDF的，如果外部软件修改了PDF导致Md5改变，就会绑定失效，MN这边需要手工重新绑定对应笔记本。 （未来会出一个智能文件名和路径识别，辅助重新绑定MD5的功能）

所以你可以说说你具体的情形，我们可以帮你分析原因，帮助优化一下工作流

Regards

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我基本的工作流是这样：

  1. zotero自身存储文献PDF附件都是在文件夹里，而文件夹的名字都是是代码，如果在平板阅读会很不好定位
  2. 所以借助了zotero的插件 叫做zotfile 把这个代码中的附件都整体迁移到了marginnote的icloud下的文件夹中，并把zotero中PDF默认的打开方式设置为marginnote
  3. 每次阅读文献都是从zotero中点击附件打开marginnote阅读（我理解的是相当于直接从icloud中的marginnote文件夹中打开）
    但是就会偶尔出现：明明之前有一个“文献A”在marginnote中做了好多标记，但是隔一段时间重新打开之后，变成了新的附件“文献A 1”，之前的倒是也没丢失，但是就是重新建了一个新的空白的副本文件

没太明白您说的MN自身的目录是哪一个，之前试过用您以前的回答：

直接设置MN内置资源库文件夹为Mendeley的归档文件夹。MN的同步机制是复制icloud文件，故该资源库文件夹同时包括了icloud同步文档和本地文档。/System/Volumes/Data/Users/用户 名/Library/Containers/QReader.MarginStudyMac/Data/Documents

但是我没找到您上面说的这个路径的文件夹，所以不太知道怎么设置，望解答，谢谢您！

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你好，请问如何设置open file externally跳转到marginnote呢，我是直接用pdf expert打开了